在东京的松阴神社，少年侦探团及时救下了被男子袭击的小早川公子小姐，为了寻找她爷爷藏起来的足以买下国家价值连城的宝藏，大伙一起前往她的老家津和野在中途的新山口车站，遇到了自称是公子小姐的朋友川子茂先生，但柯南和灰原注意到这并非他的真名，到达之后，他们又发现了新的暗号，顺着线索来到了萩市，没想到袭击公子小姐的人那些人将灰原、光彦和公子小姐带走。