此次幽灵恐慌的第二天，柯南他们下榻的民宅的主人—永仓先生被人袭击了。永仓先生虽然没有生命危险，但是犯人是谁却不得而知。警察以重要参照人为理由带走了从在进行地球遗产登陆委员会那里派来的缺德调查官川治，但柯南却发觉这其中不自然的地方，最终少年侦探团的各位找到了真正的犯人并将找出了幽灵少女的真相。